212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0382 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
510 aa  1035    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  46.44 
 
 
515 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.33 
 
 
513 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.14 
 
 
517 aa  316  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.57 
 
 
504 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 
502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  39.91 
 
 
714 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.87 
 
 
521 aa  302  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.58 
 
 
502 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  39.08 
 
 
478 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 
491 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  35.87 
 
 
525 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  36.38 
 
 
735 aa  279  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  38.49 
 
 
498 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  38.49 
 
 
483 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.74 
 
 
701 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  34.66 
 
 
714 aa  277  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  36.4 
 
 
572 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.64 
 
 
498 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  38.16 
 
 
714 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  35.26 
 
 
512 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.04 
 
 
474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  37.98 
 
 
504 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  37.89 
 
 
483 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 
518 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  38.72 
 
 
504 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  37.45 
 
 
717 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  40.85 
 
 
482 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.56 
 
 
514 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  34.36 
 
 
724 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  35.15 
 
 
739 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  35.15 
 
 
739 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.46 
 
 
503 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  33.12 
 
 
517 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.13 
 
 
713 aa  236  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.03 
 
 
803 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  35.44 
 
 
732 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  34.65 
 
 
732 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  34.65 
 
 
732 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  35.42 
 
 
735 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  36.3 
 
 
746 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  35.29 
 
 
728 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  35.08 
 
 
728 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  28.39 
 
 
730 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.73 
 
 
720 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.78 
 
 
507 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.29 
 
 
507 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.16 
 
 
738 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  31.64 
 
 
470 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  29.59 
 
 
533 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.81 
 
 
533 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.54 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.51 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.93 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  25.07 
 
 
1821 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.6 
 
 
632 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  26.62 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  28.27 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 
734 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 
754 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 
754 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  22.66 
 
 
1522 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  21.12 
 
 
1783 aa  65.1  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.4 
 
 
481 aa  64.7  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  24.64 
 
 
484 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 
681 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  24.69 
 
 
478 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  22.99 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 
510 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 
516 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 
516 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.49 
 
 
497 aa  58.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24.64 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  29.48 
 
 
693 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  29.48 
 
 
693 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  23.64 
 
 
502 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  26.99 
 
 
655 aa  57.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  21.48 
 
 
480 aa  57.4  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  24.27 
 
 
477 aa  57  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1543  phospholipase D/transphosphatidylase  20.82 
 
 
377 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0120705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  22.83 
 
 
479 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  26.74 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.35 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.48 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  23.46 
 
 
482 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 
693 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  24.54 
 
 
486 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  22.09 
 
 
479 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.08 
 
 
492 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  22.44 
 
 
490 aa  53.9  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.26 
 
 
691 aa  53.9  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.68 
 
 
486 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  22.55 
 
 
479 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.28 
 
 
382 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  22.22 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  24.63 
 
 
514 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 
467 aa  53.5  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 
505 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 
505 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.63 
 
 
487 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>