58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  100 
 
 		 1103 aa  2255    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  35.29 
 
 		 780 aa  311  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  33.6 
 
 		 818 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  32.69 
 
 		 1821 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  30.77 
 
 		 1783 aa  92.4  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  38.93 
 
 		 759 aa  88.2  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  42.27 
 
 		 1522 aa  86.3  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  69.09 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  36.36 
 
 		 1219 aa  84.7  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  34.23 
 
 		 833 aa  78.2  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  28.93 
 
 		 801 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  46.84 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 714 aa  63.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  29.47 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  32.1 
 
 		 714 aa  61.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 732 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  28.81 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  35.05 
 
 		 681 aa  57.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  26.02 
 
 		 738 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.94 
 
 		 514 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  30.41 
 
 		 739 aa  55.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  29.57 
 
 		 732 aa  55.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.57 
 
 		 732 aa  55.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.35 
 
 		 701 aa  55.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  29.9 
 
 		 739 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  27.68 
 
 		 525 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  40.79 
 
 		 504 aa  52.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  30.39 
 
 		 735 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  41.1 
 
 		 512 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 		 746 aa  52.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 		 572 aa  52  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  29.93 
 
 		 517 aa  51.6  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  29.52 
 
 		 502 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.52 
 
 		 502 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.36 
 
 		 474 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.93 
 
 		 507 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.31 
 
 		 507 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  28.42 
 
 		 728 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  26.28 
 
 		 676 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  46.27 
 
 		 684 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  25.77 
 
 		 720 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  29.52 
 
 		 728 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  29.73 
 
 		 735 aa  48.9  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  34.02 
 
 		 655 aa  48.9  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.67 
 
 		 504 aa  48.5  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.3 
 
 		 510 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  27.7 
 
 		 470 aa  48.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 		 504 aa  47.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  55.81 
 
 		 472 aa  47.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.65 
 
 		 521 aa  47.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  58.97 
 
 		 745 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  29.67 
 
 		 482 aa  46.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  38.1 
 
 		 684 aa  45.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  27.54 
 
 		 730 aa  46.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  28.4 
 
 		 477 aa  45.8  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.82 
 
 		 498 aa  45.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  50 
 
 		 652 aa  45.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  36.84 
 
 		 668 aa  45.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>