80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03737 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  100 
 
 		 652 aa  1366    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  55.37 
 
 		 655 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  52.57 
 
 		 668 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  48.78 
 
 		 684 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  28.87 
 
 		 684 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  31.61 
 
 		 745 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.96 
 
 		 691 aa  191  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  27.05 
 
 		 693 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  27.05 
 
 		 693 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  27.04 
 
 		 693 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.17 
 
 		 676 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  26.43 
 
 		 681 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 818 aa  70.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0629  putative phospholipase  50 
 
 		 66 aa  68.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  56.86 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  46.38 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.91 
 
 		 465 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  40.51 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  28.66 
 
 		 498 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  28.66 
 
 		 483 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  47.62 
 
 		 512 aa  54.3  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.98 
 
 		 504 aa  53.9  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  27.85 
 
 		 714 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.12 
 
 		 533 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  50.98 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.1 
 
 		 507 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  34.34 
 
 		 728 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  33.02 
 
 		 735 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 		 516 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  57.89 
 
 		 518 aa  52  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  35.11 
 
 		 728 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 		 516 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.89 
 
 		 507 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 		 510 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.06 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  26 
 
 		 572 aa  50.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  22.99 
 
 		 780 aa  50.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  48.78 
 
 		 502 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.37 
 
 		 503 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.34 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  28.17 
 
 		 479 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  51.43 
 
 		 491 aa  49.7  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  26.88 
 
 		 730 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  29.22 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  30.21 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  45.24 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 		 512 aa  48.9  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  57.14 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.37 
 
 		 521 aa  48.9  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.9 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  27.46 
 
 		 481 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  27.46 
 
 		 479 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.69 
 
 		 701 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 		 474 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  54.05 
 
 		 270 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  41.89 
 
 		 732 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  40.74 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.99 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  47.37 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  52.78 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.64 
 
 		 514 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  50 
 
 		 1103 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 		 739 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 		 732 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.23 
 
 		 476 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 		 732 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  30.23 
 
 		 476 aa  45.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  30.23 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  60.61 
 
 		 734 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  60.61 
 
 		 754 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  60.61 
 
 		 754 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 724 aa  44.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  26.39 
 
 		 479 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  58.82 
 
 		 546 aa  44.3  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  57.58 
 
 		 713 aa  44.3  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  33.73 
 
 		 592 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  37.93 
 
 		 717 aa  43.9  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  34.62 
 
 		 484 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  43.18 
 
 		 510 aa  43.9  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>