More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5412 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  55.46 
 
 
728 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  53.61 
 
 
732 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  53.85 
 
 
732 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  50.81 
 
 
746 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  52.96 
 
 
739 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  100 
 
 
735 aa  1474    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  55.46 
 
 
728 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  52.82 
 
 
739 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  53.85 
 
 
732 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  46.79 
 
 
735 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  42.52 
 
 
714 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  43.4 
 
 
714 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  43.63 
 
 
714 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  40.86 
 
 
717 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  40.52 
 
 
724 aa  482  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.52 
 
 
713 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.55 
 
 
701 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.72 
 
 
803 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  41.08 
 
 
525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.24 
 
 
504 aa  334  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  41.33 
 
 
483 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  41.33 
 
 
498 aa  331  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  31.58 
 
 
730 aa  327  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  41.11 
 
 
483 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.38 
 
 
498 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  42.47 
 
 
478 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.34 
 
 
521 aa  319  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  31.05 
 
 
720 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  40.6 
 
 
491 aa  318  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.79 
 
 
502 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  39.49 
 
 
502 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.38 
 
 
738 aa  310  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  38.89 
 
 
512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.7 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  41.77 
 
 
518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  39.85 
 
 
504 aa  297  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  36.67 
 
 
572 aa  290  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  39.66 
 
 
504 aa  275  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.99 
 
 
503 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  38.58 
 
 
482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  37.25 
 
 
517 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.92 
 
 
514 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  35.42 
 
 
510 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  41.56 
 
 
515 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.57 
 
 
507 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.61 
 
 
513 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.94 
 
 
507 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.76 
 
 
517 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  38.38 
 
 
252 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.9 
 
 
470 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  33.48 
 
 
232 aa  125  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  27.66 
 
 
512 aa  97.4  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 
246 aa  90.9  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  40.65 
 
 
225 aa  89  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  31.49 
 
 
226 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  32.58 
 
 
213 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  34.09 
 
 
242 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
240 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  38.81 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.87 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.63 
 
 
544 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.83 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.57 
 
 
229 aa  84  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  28.62 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  33.74 
 
 
235 aa  82  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.71 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  30.09 
 
 
533 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.49 
 
 
546 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.35 
 
 
229 aa  79.7  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  33.73 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 
325 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 
266 aa  77  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  33.08 
 
 
266 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.43 
 
 
228 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  27.89 
 
 
320 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  34.11 
 
 
239 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  26.79 
 
 
533 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 
231 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 
282 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 
282 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.21 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  24.3 
 
 
1783 aa  75.5  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  31.4 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  25.57 
 
 
623 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 
224 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
516 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
516 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 
224 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  34.92 
 
 
267 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  26.38 
 
 
227 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  31.62 
 
 
246 aa  72.8  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.77 
 
 
213 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  25.77 
 
 
227 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  72.4  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.76 
 
 
486 aa  72  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.84 
 
 
225 aa  72  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>