190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5065 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 267 aa  510  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  56.16 
 
 		 265 aa  242  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  57.99 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  57.69 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  62.44 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  58.04 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.52 
 
 		 714 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  40.57 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  42.79 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  33.9 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.52 
 
 		 714 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  41.15 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  38.54 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  35.52 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  37.93 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  36.99 
 
 		 219 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  29.2 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  27.87 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  33.77 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  33.9 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  32.43 
 
 		 226 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.38 
 
 		 746 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  28.9 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.32 
 
 		 713 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  35.32 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  30.93 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  29.27 
 
 		 713 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.16 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  40.8 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  25.23 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.76 
 
 		 705 aa  79.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.81 
 
 		 722 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 722 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  31.9 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.49 
 
 		 717 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.34 
 
 		 722 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 716 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  36.97 
 
 		 720 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  26.2 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  27.93 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  34.92 
 
 		 735 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  33.58 
 
 		 716 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.25 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  39.84 
 
 		 728 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  39.84 
 
 		 728 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.6 
 
 		 717 aa  72  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 227 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  31.32 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 		 739 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.88 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.71 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.98 
 
 		 717 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.02 
 
 		 739 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  39.02 
 
 		 732 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.29 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  39.02 
 
 		 732 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 		 732 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  32 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  37.61 
 
 		 746 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.11 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  26.61 
 
 		 704 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  25.4 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  28.05 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.2 
 
 		 701 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.71 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  34.11 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.19 
 
 		 738 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.87 
 
 		 712 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.58 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  33.08 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  26.77 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  31.54 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.32 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  33.08 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.95 
 
 		 623 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.9 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  28.4 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.26 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.22 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  29.31 
 
 		 717 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.78 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  22.17 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.96 
 
 		 713 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  33.09 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  30.35 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  32.64 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  28.22 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  27.69 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  33.83 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.64 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  32.64 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  32.64 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>