211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003943 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 228 aa  448  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  86.4 
 
 		 229 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  67.27 
 
 		 225 aa  288  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  69.76 
 
 		 229 aa  287  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  65.93 
 
 		 227 aa  266  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  57.82 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  62.5 
 
 		 713 aa  244  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  55.76 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  56.25 
 
 		 717 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  55.88 
 
 		 722 aa  235  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.88 
 
 		 713 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.5 
 
 		 717 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  56.94 
 
 		 738 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.16 
 
 		 722 aa  217  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  54.23 
 
 		 716 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.44 
 
 		 722 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  51.54 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.93 
 
 		 712 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  51.92 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  54 
 
 		 716 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.77 
 
 		 717 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.17 
 
 		 746 aa  208  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  51.43 
 
 		 720 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.79 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  46.15 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  46.49 
 
 		 704 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  45.54 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  45.25 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  46.45 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  44.02 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  43.81 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.95 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  40.99 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.15 
 
 		 705 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  37.77 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  33.18 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  35.14 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  32.2 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  34.66 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  29.55 
 
 		 714 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  30.7 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  38.01 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  35.67 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  32.64 
 
 		 244 aa  94.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  30.99 
 
 		 714 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  37.91 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  32.79 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  36.71 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  32.24 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  35.32 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  33.05 
 
 		 314 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  34.73 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  34.73 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  43.31 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  36.13 
 
 		 320 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.9 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  34.36 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  33.53 
 
 		 325 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  33.33 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  35 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  38.96 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  36.36 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  35 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  34.59 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  32.11 
 
 		 623 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  34.03 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.64 
 
 		 724 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  33.58 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  38.89 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  28.49 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  29.53 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  32 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.31 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  33.58 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  36.28 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.49 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.49 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  34.85 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  30.81 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  25.13 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  37.78 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.29 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  28.41 
 
 		 803 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  29.61 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  33.08 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  33.08 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 		 746 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  29.79 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  29.79 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>