199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1462 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  59.36 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  59.91 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  57 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.76 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  59.07 
 
 		 738 aa  234  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  63.03 
 
 		 722 aa  234  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  60.1 
 
 		 716 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.69 
 
 		 722 aa  229  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.63 
 
 		 713 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.17 
 
 		 722 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  56.4 
 
 		 717 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  53.42 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.95 
 
 		 717 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  54.11 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  57.36 
 
 		 716 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  53.69 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  56.72 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57.29 
 
 		 717 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  51.18 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57 
 
 		 746 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.85 
 
 		 712 aa  191  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  50.71 
 
 		 713 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  46.45 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  52.38 
 
 		 720 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  47.32 
 
 		 704 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  47.39 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  47.39 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  50.24 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.43 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.5 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  43.58 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.7 
 
 		 705 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  35.56 
 
 		 238 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  35.36 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  38.95 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  35.35 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  32.97 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  47.69 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  36.87 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  32.34 
 
 		 714 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  35.06 
 
 		 314 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  31.02 
 
 		 714 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  31.02 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  39.29 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  33.51 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  33.94 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  32.99 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 		 264 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  39.74 
 
 		 320 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  33.52 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.85 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.72 
 
 		 623 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  38.89 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  36.43 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  34.5 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  32.3 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  32.3 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  36.54 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  36.76 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  31.84 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.12 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  33.53 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  35.46 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  34.03 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  36.62 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  29.78 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.9 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  38.06 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  36.67 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  33.1 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  31.55 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  31.97 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  35.45 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  35.16 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  28.38 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  36.75 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  28.38 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  27.08 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.56 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.78 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  30 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  30.73 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  34.85 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.89 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  32.89 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  32.45 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  32.24 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  36.14 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>