65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1788 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 314 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  37.75 
 
 		 238 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  35.4 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.39 
 
 		 722 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  31.78 
 
 		 231 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.77 
 
 		 713 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  36.68 
 
 		 722 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.82 
 
 		 746 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  33.8 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  36.97 
 
 		 258 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  32.24 
 
 		 717 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.98 
 
 		 722 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.85 
 
 		 228 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.67 
 
 		 717 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  32.61 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  29.71 
 
 		 229 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  30.74 
 
 		 716 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  32.75 
 
 		 716 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  33.04 
 
 		 738 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.51 
 
 		 717 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.44 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  29.91 
 
 		 225 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.33 
 
 		 712 aa  92.4  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  28.39 
 
 		 713 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.37 
 
 		 705 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  29.2 
 
 		 239 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  29.52 
 
 		 227 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.17 
 
 		 228 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  32.79 
 
 		 720 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  28.27 
 
 		 704 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  29.58 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  29.17 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  28.75 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  28.75 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  28.77 
 
 		 238 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  25.74 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  26.88 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  31.6 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.78 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  29.28 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  28.1 
 
 		 238 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  25.42 
 
 		 209 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  25.55 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 714 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  26.57 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  28.27 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  26.03 
 
 		 244 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.55 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  38.06 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.42 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.21 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  32.29 
 
 		 714 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  28.27 
 
 		 238 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  27.02 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  28.33 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  46.81 
 
 		 803 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>