223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1957 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  52.23 
 
 		 717 aa  232  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  53.42 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  60.98 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.92 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  47.06 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  46.54 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  52.63 
 
 		 722 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  48.56 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.5 
 
 		 722 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.59 
 
 		 722 aa  198  7e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.63 
 
 		 717 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.05 
 
 		 713 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  47.5 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  50.72 
 
 		 716 aa  195  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  47.49 
 
 		 738 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44 
 
 		 717 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  44 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  47.14 
 
 		 716 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.28 
 
 		 746 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  44 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  47.25 
 
 		 704 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.39 
 
 		 712 aa  171  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.86 
 
 		 214 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  49.25 
 
 		 720 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  45.31 
 
 		 713 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  40.29 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  40.19 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  44.57 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.97 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.13 
 
 		 705 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  39.59 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  40.23 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  34.67 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  34.16 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  34.63 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  40.56 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  33.5 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  32.39 
 
 		 714 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  32.31 
 
 		 714 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  39.79 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  37.77 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 314 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  36.81 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  41.01 
 
 		 209 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  41.01 
 
 		 209 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  40 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  38.81 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  36.14 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  34.74 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  34.98 
 
 		 304 aa  89  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  40.91 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  38.13 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  38.62 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  33.68 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  31.92 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  39.63 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31 
 
 		 623 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  39.24 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  35.68 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  39.71 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  27.5 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  34.33 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  32.24 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.87 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.87 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.57 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  28.7 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  33.02 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  40.74 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  29.89 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  34.35 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  32.24 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  39.26 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  32.05 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  39.26 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  31.97 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  30.86 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  32.87 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  32.56 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  29.29 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.17 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 		 724 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  36.5 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  25.83 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  25.17 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>