221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2208 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  74.75 
 
 
207 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  73.96 
 
 
199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  51.3 
 
 
213 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  50.78 
 
 
207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  49.5 
 
 
213 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  45.65 
 
 
239 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  40.11 
 
 
250 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  38.62 
 
 
198 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  44.51 
 
 
225 aa  154  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  47.31 
 
 
238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  42.16 
 
 
209 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  41.62 
 
 
209 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  39.68 
 
 
198 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  42.42 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  38.62 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 
229 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  44.32 
 
 
242 aa  141  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  39.36 
 
 
264 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  37.72 
 
 
203 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
258 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  34.38 
 
 
304 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  40.56 
 
 
222 aa  97.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.38 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.57 
 
 
623 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  34.44 
 
 
308 aa  95.1  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  37.5 
 
 
149 aa  93.2  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  36.76 
 
 
174 aa  92  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  38.51 
 
 
229 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  40.94 
 
 
325 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  34.04 
 
 
713 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  32.04 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  38.96 
 
 
722 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  37.98 
 
 
225 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.66 
 
 
320 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.91 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  32.8 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  32.8 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  32.8 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  32.28 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  33.51 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  38.81 
 
 
224 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.71 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  35.14 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
716 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  35.62 
 
 
704 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.27 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.17 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.77 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.62 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.4 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.15 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 
722 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  33.79 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  37.9 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  34.44 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.94 
 
 
746 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  30.22 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  31.41 
 
 
227 aa  72  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  35.71 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.78 
 
 
738 aa  72  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  27.12 
 
 
714 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.04 
 
 
705 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  33.14 
 
 
716 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.84 
 
 
722 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.89 
 
 
713 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  34.43 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  33.77 
 
 
717 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  26.55 
 
 
714 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.58 
 
 
717 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  40.62 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  34.04 
 
 
252 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  31.62 
 
 
735 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  32.88 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.71 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  34.35 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  39.39 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  32.24 
 
 
233 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  28.03 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  31.07 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.5 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 
265 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  28.41 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  32.22 
 
 
244 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 
246 aa  61.6  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  34.13 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>