235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6600 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
238 aa  454  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  43.86 
 
 
264 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  45.15 
 
 
209 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  44.66 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  40.36 
 
 
242 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  43.27 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  43.75 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  48.4 
 
 
242 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  47.69 
 
 
238 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  38.03 
 
 
250 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  52.27 
 
 
229 aa  148  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  40.91 
 
 
266 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  41.1 
 
 
174 aa  119  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  37.88 
 
 
207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  39.89 
 
 
325 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  37.22 
 
 
320 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  40.52 
 
 
222 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  36.89 
 
 
206 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  34.15 
 
 
207 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  33.87 
 
 
213 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  34.04 
 
 
258 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  34.15 
 
 
213 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  29.1 
 
 
198 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  40.37 
 
 
229 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  32.85 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  43.66 
 
 
149 aa  99.8  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  32.54 
 
 
304 aa  99  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  32.85 
 
 
232 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  30.99 
 
 
200 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  40.14 
 
 
199 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  35.26 
 
 
185 aa  97.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  37.93 
 
 
623 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  34.42 
 
 
308 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  39.04 
 
 
224 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  29.82 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  36.31 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  39.19 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.57 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  42.74 
 
 
225 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.96 
 
 
722 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.53 
 
 
722 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  30.54 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.14 
 
 
227 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  36.09 
 
 
716 aa  88.6  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.37 
 
 
236 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  32.95 
 
 
224 aa  88.6  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  36.73 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  35.37 
 
 
236 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.86 
 
 
705 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  34.69 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  35.92 
 
 
192 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  34.69 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  41.94 
 
 
239 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  34.69 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  34.69 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  34.01 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.15 
 
 
746 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  34.01 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  35.92 
 
 
717 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  40.15 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  38.19 
 
 
229 aa  85.1  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  36.05 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  40.65 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  36.96 
 
 
738 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.56 
 
 
717 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.92 
 
 
713 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1332  SNARE associated Golgi protein  44.19 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1430  SNARE associated Golgi protein  44.19 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.159298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  41.48 
 
 
722 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 
716 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  34.85 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  36.54 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  36.54 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  35.9 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  35.14 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  36.46 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  34.93 
 
 
713 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  34.94 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  35.57 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  31.07 
 
 
225 aa  79  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.09 
 
 
717 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.29 
 
 
714 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  33.14 
 
 
714 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.72 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  34.9 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  37.67 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  31.07 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  29.88 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  31.89 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  35.34 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  33.58 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.77 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.6 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  31.97 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>