153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45676 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  38.28 
 
 
304 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  36.89 
 
 
250 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  47.13 
 
 
225 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  42.07 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43839  predicted protein  35.2 
 
 
409 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  40.24 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  33.07 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
209 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
209 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  37.63 
 
 
229 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  37.13 
 
 
242 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  31.79 
 
 
213 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  33.94 
 
 
207 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  39.76 
 
 
238 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  45.3 
 
 
199 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  44.14 
 
 
207 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  28.26 
 
 
198 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  33.57 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  30.65 
 
 
198 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  32.03 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  29.94 
 
 
200 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.12 
 
 
236 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  33.12 
 
 
236 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  34.16 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  34.16 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  32.5 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  32.5 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  32.5 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.87 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  30.85 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.14 
 
 
705 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.02 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.35 
 
 
713 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  32.28 
 
 
149 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.87 
 
 
236 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  31.94 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  27.22 
 
 
203 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  29.41 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  27.5 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  25.33 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  33.12 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 
240 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  37.23 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.61 
 
 
623 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.7 
 
 
746 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  27.85 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  26.7 
 
 
714 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  31.08 
 
 
225 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  26.7 
 
 
714 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  27.93 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  37.5 
 
 
185 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 
716 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  28.72 
 
 
226 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  28.92 
 
 
713 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  25.77 
 
 
220 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  28.35 
 
 
229 aa  62.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  28.21 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  27.67 
 
 
239 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  28.26 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  23.86 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  29.1 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 
722 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  30.71 
 
 
230 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  30.71 
 
 
230 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.94 
 
 
717 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  24.24 
 
 
717 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  27.93 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.83 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.57 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  28.48 
 
 
215 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  31.76 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  27.55 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.04 
 
 
200 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  25 
 
 
738 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  27.97 
 
 
716 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  25.51 
 
 
224 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  26.86 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  26.36 
 
 
732 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  27.39 
 
 
220 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  26.62 
 
 
226 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25.96 
 
 
717 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 
732 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 
732 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26.05 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26.05 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 
227 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.84 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 
722 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.81 
 
 
722 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  32.63 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  32.63 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25.93 
 
 
712 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  29.11 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>