179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2222 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 200 aa  364  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  38.15 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  33.91 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  36.27 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  38.04 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  41.3 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  35.56 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  35.56 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  34.08 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.88 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  35.58 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.6 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.84 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  29 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  36.88 
 
 		 714 aa  65.5  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.65 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.55 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  26.88 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  36.21 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  35.9 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  34.75 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3450  SNARE associated Golgi protein  39.16 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  34.78 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  33.57 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.41 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  31.43 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  31.43 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  32.41 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.21 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  37.07 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  31.97 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  31.22 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  29.7 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  31.88 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  34.65 
 
 		 714 aa  58.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.24 
 
 		 720 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  34.23 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.66 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  34.68 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.17 
 
 		 701 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  28.87 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  34.31 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 746 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  39.56 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  36.5 
 
 		 732 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  36.5 
 
 		 732 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  31.21 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  35.66 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  32.64 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 		 732 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  41.18 
 
 		 728 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  29.82 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  41.18 
 
 		 728 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  34.68 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.03 
 
 		 746 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3224  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  31.21 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  39.56 
 
 		 735 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  25.79 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2511  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.33 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.8 
 
 		 282 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  31.9 
 
 		 717 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  29.89 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  40.51 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  40.51 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 		 739 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 		 739 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  34 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.17 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.17 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  33.81 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>