158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4825 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
247 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3450  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 
251 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3224  hypothetical protein  36.95 
 
 
264 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  35.24 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.55 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  38.51 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  35.71 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.18 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.42 
 
 
623 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  26.73 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  27.44 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  34.62 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  24.46 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  28.96 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.92 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  28.92 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  31.25 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  26.97 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  28.45 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  24.88 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 
714 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  29.71 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.43 
 
 
701 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  27.49 
 
 
194 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  30.94 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  29.3 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  26.67 
 
 
714 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.6 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.38 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  22.38 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  22.27 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  28.44 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  28.44 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  22.27 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  22.27 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  22.08 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  22.27 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  26.24 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  25.75 
 
 
213 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.57 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  28.86 
 
 
714 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  26.57 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  29.19 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  26.57 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  22.27 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.93 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  26.29 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.36 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  26.79 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  23.9 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  24.88 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  28.08 
 
 
198 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.45 
 
 
732 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  29.45 
 
 
732 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  28.17 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  29.38 
 
 
226 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  27.59 
 
 
207 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  23.39 
 
 
192 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  26.9 
 
 
198 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 
732 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 
209 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10636  transmembrane protein  31.71 
 
 
246 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238726  normal  0.438888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  29.25 
 
 
735 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.65 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  24.44 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  28.68 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  27.23 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.03 
 
 
720 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  27.11 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  25.41 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  27.11 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  27.11 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.14 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.03 
 
 
735 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  25.73 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  29.44 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  26.9 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  25.51 
 
 
717 aa  52  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.34 
 
 
713 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 
746 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.95 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>