95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10636 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10636  transmembrane protein  100 
 
 
246 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238726  normal  0.438888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  77.4 
 
 
220 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  77.4 
 
 
220 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  77.4 
 
 
220 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  64.6 
 
 
229 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  65.04 
 
 
227 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.36 
 
 
243 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  39.36 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  43.51 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.3 
 
 
320 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  35.39 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.66 
 
 
623 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
325 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  25.53 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.14 
 
 
217 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  30.65 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.72 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.56 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  29.93 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.51 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3450  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.67 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  31.29 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  19.44 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  34.31 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  28.65 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.47 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.26 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  28.08 
 
 
234 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.35 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  22.77 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  22.01 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  23.98 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  22.35 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.66 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  25.82 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  30.15 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  21.79 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  21.79 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  28.39 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  27.33 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  21.79 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  18.33 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  21.79 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.99 
 
 
735 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  27.68 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  21.79 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  28.88 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  26.8 
 
 
209 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 
209 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  27.33 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  20.67 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  27.46 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3224  hypothetical protein  34.56 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.07 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.78 
 
 
717 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.36 
 
 
738 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  20.67 
 
 
236 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.56 
 
 
283 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  25.37 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  28.67 
 
 
252 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  23.12 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  23.12 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  30 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  26.98 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  26.98 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  26.88 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  22.07 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.45 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  26.2 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  25.17 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  24.53 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  27.84 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  27.4 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.04 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  25.37 
 
 
724 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  24.26 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  23.33 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  26.81 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  32.77 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  25.67 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  25.67 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  27.78 
 
 
211 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>