More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1435 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  33.6 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  31.88 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  28.21 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.11 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  29.56 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  26.82 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.33 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  28.46 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  28.92 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  27.91 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  28.92 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  32.41 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  29.1 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  30.6 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  27.33 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1596  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.06 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  27.04 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.11 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  28.31 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  24.62 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  24.62 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.06 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.73 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  32.31 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  31.39 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.77 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  29.75 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  30.71 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  29.75 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  29.75 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  33.66 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  26.95 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.78 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.04 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  28.1 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  27.93 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  28.07 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  32.03 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  35.05 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  29.7 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.98 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  27.88 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.03 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  26.92 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  29.41 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  34.52 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  29.25 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  28.1 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  23.87 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  25.35 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  29.68 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  30 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  34.52 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  30.97 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  29.13 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  34.52 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.93 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  34.09 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  28.18 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.72 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 334 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  32.45 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  27.52 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  34.09 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2511  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.7 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.48 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  31.93 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.87 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  27.69 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  27.35 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  29.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  29.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  29.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  29.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  29.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  29.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  29.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  26.45 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>