192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1172 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  450  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  65.62 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  54.02 
 
 		 227 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  41.5 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1535  hypothetical protein  45.27 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  34.87 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  34.54 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  35.05 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  34.54 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  35.05 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0135  hypothetical protein  37.25 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0975  hypothetical protein  39.74 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  33.16 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  36.36 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1112  hypothetical protein  31.82 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  28.42 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  34.13 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  25.32 
 
 		 713 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.63 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  29.6 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  27.84 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  28.48 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 		 738 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  25.45 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  30.73 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.16 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  24.21 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  31.85 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  28.06 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.79 
 
 		 722 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.28 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.9 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  25.64 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 716 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.8 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  26.95 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  28.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  27.14 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  27.14 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  34.04 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  27.61 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  27.14 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.53 
 
 		 722 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  28.38 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  27.14 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.87 
 
 		 705 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  28.26 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  26.15 
 
 		 714 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  24.63 
 
 		 735 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  27.38 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.63 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.63 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  27.78 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0073  hypothetical protein  36.49 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.57 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.09 
 
 		 717 aa  55.1  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  24.66 
 
 		 714 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  29.55 
 
 		 738 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  26.21 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  29.73 
 
 		 720 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  23.97 
 
 		 746 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  23.91 
 
 		 717 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  24.38 
 
 		 714 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  23.67 
 
 		 713 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  23.04 
 
 		 623 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  24.83 
 
 		 714 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  28.37 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  27.94 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  27.4 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>