18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0073 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0073  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  206  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  93.4 
 
 
221 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  93.4 
 
 
221 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  93.4 
 
 
221 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  85.85 
 
 
219 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  85.85 
 
 
219 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  85.85 
 
 
219 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  81.13 
 
 
219 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  60.38 
 
 
225 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  54.72 
 
 
221 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  38.61 
 
 
250 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  44.44 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  36.49 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  31.07 
 
 
227 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  33.78 
 
 
239 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  34.29 
 
 
238 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0135  hypothetical protein  48.08 
 
 
250 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  26.25 
 
 
225 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>