108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0975 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0975  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  50.96 
 
 
243 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  43.83 
 
 
250 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  40.65 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  37.72 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  39.47 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  44.14 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1535  hypothetical protein  46.84 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  39.38 
 
 
221 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  39.38 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  39.38 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  38.71 
 
 
219 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  38.71 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  39.73 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  41.33 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  31.13 
 
 
238 aa  95.5  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0135  hypothetical protein  34.42 
 
 
250 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  39.23 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  34.78 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  31.48 
 
 
735 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 
714 aa  58.9  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 
245 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.93 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.4 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.7 
 
 
738 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  33.55 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.48 
 
 
722 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 
724 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  39.08 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  35.25 
 
 
746 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.79 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  29.1 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  28.95 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  37.5 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.49 
 
 
722 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  26.23 
 
 
720 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  37.19 
 
 
728 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  33.01 
 
 
714 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  28.79 
 
 
714 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  36.59 
 
 
732 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  36.59 
 
 
732 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  36.59 
 
 
732 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  29.27 
 
 
267 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.74 
 
 
705 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  25 
 
 
717 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  28.38 
 
 
226 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  32.79 
 
 
252 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  28.43 
 
 
713 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3450  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 
251 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  27.83 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  26.16 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.48 
 
 
713 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  36.36 
 
 
728 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  33.13 
 
 
271 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  25.6 
 
 
714 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  35.8 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  33.03 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.24 
 
 
713 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1112  hypothetical protein  26.77 
 
 
226 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  28.15 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  28.49 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  26.06 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 
264 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  24.84 
 
 
252 aa  45.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  25.87 
 
 
174 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  28.82 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.57 
 
 
717 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  29.1 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  32.74 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 
266 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.13 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3224  hypothetical protein  32 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  30.51 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  33.01 
 
 
714 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  24.37 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25 
 
 
717 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  26.19 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.89 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  31.97 
 
 
739 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  31.97 
 
 
739 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  24.16 
 
 
253 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  25 
 
 
236 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  25 
 
 
236 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
236 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  30.4 
 
 
255 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  23.53 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  30.4 
 
 
255 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>