More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2829 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  41.03 
 
 
235 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  41.03 
 
 
235 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  41.03 
 
 
235 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  41.03 
 
 
235 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  41.03 
 
 
235 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  41.03 
 
 
235 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.13 
 
 
235 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  41.13 
 
 
235 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  40.6 
 
 
235 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  40.19 
 
 
237 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  41.04 
 
 
239 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  38.97 
 
 
231 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  38.97 
 
 
231 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.74 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  49.66 
 
 
194 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  32.09 
 
 
249 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  38.83 
 
 
231 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  33.04 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 
229 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.76 
 
 
235 aa  85.9  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  37.43 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  37.43 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  34.69 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  30.71 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  37.91 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  31.29 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  30.05 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  31.25 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  39.04 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  30.85 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  35.25 
 
 
623 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.05 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.55 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.15 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  29.63 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.28 
 
 
713 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.63 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.56 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  31.33 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.63 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.63 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.1 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  29.1 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  35 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  35.14 
 
 
722 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.63 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  29.03 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  30.26 
 
 
192 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  30.65 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  32.23 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  32 
 
 
717 aa  62.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  31.38 
 
 
223 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  34.19 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  31.45 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  33.12 
 
 
185 aa  62  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.98 
 
 
320 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28.42 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  34.26 
 
 
714 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  33.07 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  31.4 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.75 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  26.86 
 
 
803 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 
197 aa  59.7  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.04 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  29.61 
 
 
193 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  31.03 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
226 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  35 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  28.85 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  29.38 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  32.43 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  32.43 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  30.11 
 
 
205 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  31.4 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  28.57 
 
 
704 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.25 
 
 
717 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  32.43 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  32.87 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>