181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2545 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  30.43 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  30.43 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  32.64 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.57 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  29.57 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.65 
 
 		 251 aa  84.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  34.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  34.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  34.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  34.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  34.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  34.18 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  31.67 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  33.54 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  29.03 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  29.87 
 
 		 237 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.28 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  27.69 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  27.69 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  29.33 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  27.54 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.5 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  29.69 
 
 		 717 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.77 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  31.41 
 
 		 325 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.34 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.17 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  29.61 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  26.8 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.12 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  32.79 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  29.27 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  31.4 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  36.28 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  24.86 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  27.1 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  23.66 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  26.75 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  25.75 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.34 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  28.81 
 
 		 714 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.68 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  25.66 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25.66 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25.66 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  25.66 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2616  SNARE associated Golgi protein  29.37 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  25.66 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.77 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  28.29 
 
 		 223 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.66 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  25.66 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  26.17 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  30.83 
 
 		 267 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  24.68 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  26.17 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  28.68 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2523  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.6 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.81 
 
 		 623 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  28.75 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  26.06 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  29.2 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  25.32 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  28.92 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 		 732 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  24.2 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  26.06 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  24.2 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  29.14 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  24.2 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  33.05 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  26.85 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  29.37 
 
 		 717 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  48.5  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 		 724 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>