More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01721 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  99.15 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  99.15 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  99.15 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  99.15 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  55.45 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  55.45 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  55.77 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  57.07 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  55.68 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  51.02 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  44.9 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  32.28 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.55 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  34.21 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  34.62 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  32.24 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.74 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.36 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  29.91 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.94 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  28.93 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  34.18 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.55 
 
 		 746 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  33.64 
 
 		 623 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  34.97 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  31.29 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.7 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  29.53 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.66 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  32.12 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  28.04 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  33.06 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  33.09 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  28.21 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  31.67 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  32.41 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  28.5 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  33.06 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  27.43 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.92 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  28.1 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  28.1 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  27.13 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 714 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  27.96 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  28.42 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  28.11 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  25.67 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.07 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  32.89 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  26.9 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  26.24 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  28.9 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  27.78 
 
 		 714 aa  65.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.01 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  30.43 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.43 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  35.07 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  26.4 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.4 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.4 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  26.4 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 		 722 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  26.17 
 
 		 720 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3450  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0963  hypothetical protein  23.6 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.59 
 
 		 716 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  30.05 
 
 		 732 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0982  hypothetical protein  23.6 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  26.4 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.29 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  28.46 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>