244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0474 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 224 aa  427  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  97.32 
 
 		 224 aa  417  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  70.85 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  69.06 
 
 		 226 aa  299  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  67.26 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  66.96 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  47.17 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.24 
 
 		 722 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.71 
 
 		 722 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  47.39 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  48.08 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.66 
 
 		 713 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.06 
 
 		 717 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  48.1 
 
 		 717 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  49.53 
 
 		 738 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  45.74 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.25 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  49.07 
 
 		 716 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.69 
 
 		 717 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  47.25 
 
 		 716 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.16 
 
 		 746 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.33 
 
 		 712 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  47.42 
 
 		 722 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  45.1 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  42.36 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  42.72 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  48.51 
 
 		 720 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  43.81 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  41.41 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  38.86 
 
 		 704 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  40.1 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.28 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  37.9 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  42.56 
 
 		 713 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.69 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  33.98 
 
 		 714 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.15 
 
 		 714 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.95 
 
 		 705 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  33.66 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  37.89 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  48.06 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  38.95 
 
 		 266 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  35.62 
 
 		 623 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  40.76 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  44.19 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  33.47 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  35.23 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  33.73 
 
 		 282 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  33.73 
 
 		 282 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  36.02 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  32.9 
 
 		 246 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  35.8 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  34.5 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  36.17 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 264 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  35.15 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.81 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  33.69 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  35.15 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  35.78 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  34.09 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  33.52 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  38.76 
 
 		 325 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  41.35 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  34.84 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  38.62 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  36.02 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  39.34 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.99 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  39.53 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  39.53 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  37.21 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  36.43 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  38.46 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  39.82 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  33.55 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  32.14 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  39.69 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  27.32 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  39.42 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.6 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.04 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  33.58 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  35.25 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.25 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  42.11 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  29.88 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  34.97 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  34.53 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  34.53 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  34.55 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  34.53 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>