143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1919 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  460  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  40.18 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  43.46 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.42 
 
 		 722 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  39.57 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.9 
 
 		 722 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  35.94 
 
 		 717 aa  128  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  43.53 
 
 		 722 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.85 
 
 		 717 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  36.2 
 
 		 738 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.89 
 
 		 713 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  36.81 
 
 		 716 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  34.21 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  30.57 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.59 
 
 		 717 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  34.08 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  34.92 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  40.12 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 716 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  34.76 
 
 		 704 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.54 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.16 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  35.6 
 
 		 713 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.02 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  31.12 
 
 		 229 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.16 
 
 		 746 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.01 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  31.92 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  34.5 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  32.4 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 		 720 aa  95.1  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.82 
 
 		 705 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.63 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  36 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.41 
 
 		 712 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  32.83 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  35.61 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  29.34 
 
 		 714 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  32.64 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  30.51 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  36.81 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  27.11 
 
 		 714 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  30.37 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  29.38 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  30.62 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.6 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  34.87 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  34.87 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  29.38 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  31.03 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.84 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  36.99 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.48 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  28.86 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  33.09 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  32.37 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  28.48 
 
 		 623 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  34.4 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  28.63 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  34.33 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  29.3 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  28.04 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  29.82 
 
 		 149 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.2 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  33.76 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  30.61 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  27.52 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  29.86 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  27.92 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  31.58 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.16 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  27.39 
 
 		 304 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  26.06 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  30.16 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  25.45 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  23.97 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.86 
 
 		 713 aa  48.5  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  31.15 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>