227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02677 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  39.52 
 
 
236 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  39.52 
 
 
236 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  39.52 
 
 
236 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  39.52 
 
 
236 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  39.52 
 
 
236 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.55 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  39.55 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  42.78 
 
 
192 aa  161  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  42.54 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 
209 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 
209 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  42.33 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  45.03 
 
 
238 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  38.86 
 
 
242 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  41.4 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  40.65 
 
 
229 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  33.67 
 
 
320 aa  111  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  35.47 
 
 
623 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  38.51 
 
 
229 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
325 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.41 
 
 
746 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.63 
 
 
222 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.07 
 
 
230 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.28 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.46 
 
 
705 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  34.43 
 
 
722 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  40.69 
 
 
717 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  32.57 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  37.42 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  32.42 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.73 
 
 
174 aa  91.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  35.56 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.98 
 
 
738 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  35.88 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  35.42 
 
 
199 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  34.68 
 
 
265 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  35.76 
 
 
149 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.88 
 
 
722 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.43 
 
 
722 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  30.38 
 
 
232 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.01 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  30.38 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 
716 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  33.54 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.52 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  34.84 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.44 
 
 
716 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.73 
 
 
717 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  34.22 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.39 
 
 
704 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.8 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  36.91 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.22 
 
 
717 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  39.37 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  31.43 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 
282 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  31.22 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  34.23 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.94 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  36.91 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  31.11 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.6 
 
 
712 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.21 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  34 
 
 
185 aa  79  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  35.16 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  30.11 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  33.54 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  30.11 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  30.11 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  32.59 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.46 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  32.34 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.82 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.22 
 
 
713 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  29.66 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.21 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  36.67 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  35.34 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  33.11 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  31.08 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.85 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  30.86 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  29.63 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  28.06 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>