203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2552 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  57.08 
 
 		 236 aa  268  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  61.4 
 
 		 717 aa  267  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  63.77 
 
 		 716 aa  262  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  60.09 
 
 		 738 aa  260  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  59.91 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.82 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57.27 
 
 		 713 aa  254  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  60.87 
 
 		 722 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  57.35 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  58.29 
 
 		 716 aa  250  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  58 
 
 		 229 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.25 
 
 		 717 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.1 
 
 		 717 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  54.09 
 
 		 722 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.18 
 
 		 722 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  57.08 
 
 		 720 aa  221  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  52.94 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.94 
 
 		 712 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  46.49 
 
 		 704 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  47.06 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  53.61 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.42 
 
 		 746 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  51.27 
 
 		 713 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  53.3 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  50.24 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  47.64 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.71 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  48.64 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  48.08 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  47.6 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  43.98 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.86 
 
 		 705 aa  154  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.26 
 
 		 714 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  37.79 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.18 
 
 		 714 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  38.85 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  34.44 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  34.72 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  32.34 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  32.63 
 
 		 266 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  38.82 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  36.53 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  34.97 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  43.44 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  34.13 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  34.43 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  41.54 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  38.35 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  33.12 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.98 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  34.75 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  31.88 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  28.31 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  28.31 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 		 724 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.57 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  26.83 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  33.58 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  34.43 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  38.26 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.88 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.15 
 
 		 623 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  31.79 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  32.07 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  29.93 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  34.88 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  29.35 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.99 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  32.52 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  27.95 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  27.95 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  31.07 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  28.05 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  29.63 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  27.95 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  27.95 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.33 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  29.81 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.09 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  27.95 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  33.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  29.38 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.32 
 
 		 713 aa  65.5  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  26.76 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>