218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2237 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  43.07 
 
 
242 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  38.61 
 
 
242 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 
209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  42.11 
 
 
239 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  38.84 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  38.46 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  35.75 
 
 
250 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  40.41 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.82 
 
 
238 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  35.76 
 
 
174 aa  105  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 
325 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.23 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  33.17 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  30.05 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  37.14 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  34.25 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  32.61 
 
 
623 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  35.48 
 
 
207 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  35.48 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  36.67 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.18 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  35.84 
 
 
185 aa  85.5  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  38.51 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.56 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  32.28 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.77 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  27.81 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  30.77 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.22 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  30.98 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  30.85 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  30.22 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  30.22 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  30.56 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  30.56 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  30.56 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  28.48 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  38.19 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  32.05 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  33.08 
 
 
735 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  32.21 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  36.13 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  31.69 
 
 
714 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  31.41 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.83 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  30.12 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.14 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  32.41 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  29.65 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  31.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  28 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  30.12 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  29.65 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  30.51 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  30.72 
 
 
217 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  31.48 
 
 
735 aa  72  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  32.41 
 
 
235 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  32.41 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.41 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  31.29 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  32.41 
 
 
235 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  32.41 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  32.41 
 
 
235 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  32.41 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  32.41 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.36 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  33.1 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  33.33 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43839  predicted protein  30 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416143  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  31.63 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  26.82 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  30.82 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  32.21 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  24.49 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  30.61 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  31.97 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  36.69 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.59 
 
 
701 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  32.89 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  29.03 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  31.11 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  28.38 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1332  SNARE associated Golgi protein  39.69 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  24.59 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>