88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43839 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43839  predicted protein  100 
 
 		 409 aa  842    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416143  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  32.22 
 
 		 304 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  35.2 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  37.27 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  30.48 
 
 		 250 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  30.04 
 
 		 209 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  30.04 
 
 		 209 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  35 
 
 		 225 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  35.57 
 
 		 238 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  31.64 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.14 
 
 		 705 aa  72.8  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 		 229 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  28 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  28.77 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.53 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  41.79 
 
 		 149 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  25.87 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  23.78 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  23.97 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  23.78 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.83 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.39 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.71 
 
 		 238 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  28 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.03 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  34.86 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  34.86 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.35 
 
 		 713 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  24.64 
 
 		 206 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  33.03 
 
 		 237 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.67 
 
 		 232 aa  53.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  27.74 
 
 		 717 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 716 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  33.33 
 
 		 185 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  30.07 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.8 
 
 		 722 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.14 
 
 		 722 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  27.5 
 
 		 226 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  21.68 
 
 		 198 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  26.83 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  21.3 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.4 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.19 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.55 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25.19 
 
 		 236 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  29.84 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  26.58 
 
 		 227 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  25.62 
 
 		 738 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  25.19 
 
 		 236 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 		 236 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  25.19 
 
 		 236 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  21.3 
 
 		 198 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  26.58 
 
 		 227 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.05 
 
 		 717 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  25.19 
 
 		 192 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  28.37 
 
 		 229 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  26.04 
 
 		 803 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.44 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  24.44 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  26.81 
 
 		 716 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  26.75 
 
 		 704 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  31.4 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0657  hypothetical protein  27 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85178e-22 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  27.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  27 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  27 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 		 231 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  25.16 
 
 		 238 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  27 
 
 		 182 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  30.36 
 
 		 239 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 		 236 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 		 227 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  27.45 
 
 		 252 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 		 224 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  30.48 
 
 		 234 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  27 
 
 		 182 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>