More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3865 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  63.51 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  63.47 
 
 
231 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  63.47 
 
 
231 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  57.07 
 
 
235 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  57.07 
 
 
235 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  57.07 
 
 
235 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  57.07 
 
 
235 aa  238  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  57.07 
 
 
235 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  57.07 
 
 
235 aa  238  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  57.07 
 
 
235 aa  238  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  57.07 
 
 
235 aa  238  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  57.07 
 
 
235 aa  237  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  63.02 
 
 
194 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  55.72 
 
 
239 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  41.09 
 
 
252 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  37.1 
 
 
231 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  34.55 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  34.22 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  32.8 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.13 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  23.56 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  29.49 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  34.9 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  27.16 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  30.07 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  30.65 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  33.58 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  32.69 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.99 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  30.38 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  33.33 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  32.81 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  30.65 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.65 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  26.7 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  30.95 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  25.71 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  28.67 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  27.72 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  27.21 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  34.75 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  27.92 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  30.19 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  30.87 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  27.43 
 
 
717 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  32.24 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  28.38 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.48 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  28.42 
 
 
197 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 
325 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.26 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 
714 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  26.76 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  26.76 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  27.21 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  25.78 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.89 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  26.82 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.94 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.65 
 
 
722 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  28.72 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  24.49 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  28.57 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.49 
 
 
623 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.62 
 
 
746 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  27.6 
 
 
246 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  32.95 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.01 
 
 
722 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  25.93 
 
 
714 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  26.38 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  28.46 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  27.11 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  29.49 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
714 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2523  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.88 
 
 
185 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  31.52 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  30 
 
 
713 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>