256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1998 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  98.96 
 
 		 236 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  97.92 
 
 		 236 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  98.96 
 
 		 236 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  98.96 
 
 		 236 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  97.92 
 
 		 236 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  98.44 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  97.4 
 
 		 236 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  97.92 
 
 		 236 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  42.78 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  39.13 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  36.53 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 325 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  35 
 
 		 623 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  38.36 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  39.44 
 
 		 320 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  41.22 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  35.42 
 
 		 250 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  38.17 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  38.34 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  37.32 
 
 		 264 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.68 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  34.25 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  38.03 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  36.3 
 
 		 225 aa  95.9  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  42.28 
 
 		 229 aa  95.5  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.33 
 
 		 746 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  35.1 
 
 		 223 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  35.37 
 
 		 220 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  35.4 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  34.34 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  33.54 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  33.75 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  32.5 
 
 		 308 aa  81.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  29.61 
 
 		 304 aa  81.3  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 		 716 aa  81.3  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  30.22 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.53 
 
 		 705 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  35.88 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  32.32 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  33.55 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  35.04 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  32.88 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.32 
 
 		 713 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.06 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  32.39 
 
 		 716 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  32.85 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  35.46 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  34.48 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  34.42 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  32.97 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  30.56 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  24.73 
 
 		 717 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  32.42 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  33.33 
 
 		 714 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  32.31 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  30.08 
 
 		 717 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  28.49 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.43 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  34.56 
 
 		 722 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.14 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  32.58 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.59 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  31.54 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  32.58 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  28.31 
 
 		 704 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.14 
 
 		 717 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  30.13 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.62 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  31.39 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  30.66 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  31.62 
 
 		 738 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.92 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  30.15 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  29.55 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.85 
 
 		 732 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 		 732 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  29.85 
 
 		 732 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  29.63 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.63 
 
 		 717 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  27.42 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  32.85 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  27.95 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.43 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  29.61 
 
 		 713 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.13 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>