178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1595 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
234 aa  454  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  33.95 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 
267 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  33.86 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  38 
 
 
238 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  33.14 
 
 
254 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  36.36 
 
 
211 aa  99  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  29.31 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  29.31 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  30.13 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  29.94 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  29.02 
 
 
272 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  29.41 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 
197 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  29.41 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  29.41 
 
 
235 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.41 
 
 
235 aa  89  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 
235 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  29.41 
 
 
235 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  29.41 
 
 
235 aa  89  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  29.41 
 
 
235 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
236 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  29.41 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  35 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  30.88 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  30.71 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  32.32 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26.7 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26.7 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  29.78 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.88 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.68 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  31.29 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  33.11 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.92 
 
 
623 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  25.99 
 
 
231 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.58 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  28.19 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  24.53 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  31.63 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.46 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  30.54 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  28.88 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.58 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  29.01 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  28.49 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.32 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  35.43 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  27.52 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.13 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  30.69 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  29.1 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  30.73 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  25.56 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.97 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  24.61 
 
 
738 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  30.15 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20181  hypothetical protein  29.56 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  27.47 
 
 
246 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  28.72 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  22.22 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  28.33 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  28.48 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.26 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  26.29 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  25.18 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  29.13 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.97 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.87 
 
 
735 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.64 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  29.22 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  23.64 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.73 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  24.74 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.28 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  24.74 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.93 
 
 
720 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03321  hypothetical protein  25.81 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  24.74 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  25.91 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.89 
 
 
738 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.59 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03931  hypothetical protein  29.38 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.748515  normal  0.0749833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1679  hypothetical protein  29.38 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0162437  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  24.43 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.94 
 
 
746 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03331  hypothetical protein  25.35 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  26.9 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  29.41 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>