166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0314 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  472  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  55.79 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  64.45 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  54.11 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  53.36 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  44.08 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  39.21 
 
 		 714 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  38.16 
 
 		 714 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  39.71 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  32.93 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  36.41 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  35.68 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  37.22 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.09 
 
 		 717 aa  98.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.17 
 
 		 713 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  30.19 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  34.3 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.59 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.93 
 
 		 228 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  34.12 
 
 		 717 aa  95.9  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  31.94 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  36.97 
 
 		 722 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  36.02 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  31.84 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  35.35 
 
 		 224 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.77 
 
 		 717 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  33.02 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.36 
 
 		 722 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.04 
 
 		 738 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  34.12 
 
 		 716 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.18 
 
 		 722 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 		 716 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  30.19 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.14 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.41 
 
 		 746 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  29.27 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  31.25 
 
 		 704 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.63 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.5 
 
 		 705 aa  72.4  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  27.84 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  31.12 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  31.66 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  24.35 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  32.84 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  26.04 
 
 		 713 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.4 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.4 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.01 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.01 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  27.01 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.01 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  28.11 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  29.87 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  27.18 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.01 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  30.96 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  28.4 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  27.33 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  31.52 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  26.07 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  27.56 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  25.13 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  28.08 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.41 
 
 		 712 aa  59.3  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03910  transmembrane protein, putative  24.16 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  30.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.41 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  28.42 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  28.42 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.33 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  28.49 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  31.61 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.58 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.77 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.03 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  29.23 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>