219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4098 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 282 aa  530  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  99.29 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  92.74 
 
 		 265 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  56.85 
 
 		 267 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  54.67 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  54.1 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  42.22 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  34.94 
 
 		 245 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  45.41 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.74 
 
 		 714 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  42.47 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  32.72 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  33.73 
 
 		 714 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  32.59 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  33.71 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  28.51 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 		 746 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  34.32 
 
 		 226 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.32 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.73 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  37.24 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  34.18 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 		 220 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 722 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  32.75 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  33.16 
 
 		 738 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.86 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  28.05 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.85 
 
 		 722 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  34.25 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.92 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.06 
 
 		 717 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.83 
 
 		 722 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  36.96 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  32.02 
 
 		 623 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  27.31 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.83 
 
 		 717 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.59 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  30.16 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  27.9 
 
 		 716 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  32.18 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  41.03 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  28.74 
 
 		 713 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  32.72 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.07 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  25.89 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  35.5 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.89 
 
 		 713 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  28.31 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  37.27 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  34.19 
 
 		 735 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.72 
 
 		 705 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  28.49 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.03 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.06 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.06 
 
 		 227 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  35.54 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  28.23 
 
 		 704 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  26.03 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  34.56 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.9 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  33.08 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.57 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  37.29 
 
 		 732 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  31.74 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  35.2 
 
 		 724 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  29.57 
 
 		 714 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  32.34 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  37.29 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  37.29 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  26.88 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  34.55 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  31.1 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  34.72 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  33.33 
 
 		 728 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  32.22 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.38 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 		 714 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 		 746 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  33.33 
 
 		 728 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  36.8 
 
 		 739 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  26.55 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  36.8 
 
 		 739 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  26.67 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.93 
 
 		 712 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  34.46 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  26.67 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.67 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  29.24 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  30.38 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.67 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  41.51 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  31.5 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  26.67 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>