218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2793 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 218 aa  407  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  34.05 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  35.83 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.45 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  30.22 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  40.51 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.84 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  34.59 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  30.77 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  36.19 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  32.43 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  32.43 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  32.43 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.27 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  38.61 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  35.21 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  35.12 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  29.27 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  33 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  30.99 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  27.56 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.94 
 
 		 623 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  32.73 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  33.74 
 
 		 714 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  34.39 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  31.64 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  34.23 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  32.59 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.03 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  29.28 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  27.42 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  21.86 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  29.11 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  24.06 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.14 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.04 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  40.32 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.61 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  32.3 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  30.05 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  30.61 
 
 		 714 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  30.56 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  25.79 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  25.79 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.75 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.81 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.75 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  35.66 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.88 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  26.75 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  26.75 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  26.75 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  26.75 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  26.75 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.45 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.11 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  29.55 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  33.56 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  28.93 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  29.73 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.85 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  25.17 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  31.82 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  27.7 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  26.74 
 
 		 717 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  26.76 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  37.07 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  28.95 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.12 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  31.67 
 
 		 735 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  35.57 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  21.85 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  21.85 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.67 
 
 		 717 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  30.87 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  31.39 
 
 		 714 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  38.1 
 
 		 716 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.3 
 
 		 713 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.14 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.34 
 
 		 738 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  31.08 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  32.09 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  30.82 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.06 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  25.64 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  29.27 
 
 		 735 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  28.17 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>