186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5116 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  72.52 
 
 		 278 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  54.36 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  56.43 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  55.75 
 
 		 282 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  55.73 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.6 
 
 		 714 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  32.51 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  41.83 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  37.9 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  35.62 
 
 		 252 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  33.02 
 
 		 714 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  41.54 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  29.65 
 
 		 224 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  35.71 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  34.19 
 
 		 226 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  34.02 
 
 		 238 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  33.7 
 
 		 220 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  27.8 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  28.51 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  26.61 
 
 		 239 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  27.15 
 
 		 224 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.78 
 
 		 746 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 227 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  33.13 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  41.6 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.56 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  31.51 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  30.83 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  29.82 
 
 		 722 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  28.8 
 
 		 738 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.15 
 
 		 722 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  26.22 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.32 
 
 		 722 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.62 
 
 		 229 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  26.25 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.37 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  28.17 
 
 		 704 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  26.26 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.59 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.27 
 
 		 713 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  27.1 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  26.09 
 
 		 716 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.34 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  28.15 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  31.54 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.1 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.88 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  36.17 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  22.82 
 
 		 717 aa  66.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  26.85 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  26.71 
 
 		 713 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.25 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  30.94 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  29.66 
 
 		 735 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  37.91 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  27.88 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.43 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  32.56 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  31.67 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.11 
 
 		 701 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.53 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.46 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.46 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  32.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  26.01 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  28.68 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  30.86 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  29.51 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.69 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  27.52 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.59 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  31.08 
 
 		 728 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  28.78 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  26.26 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  26.26 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  28.22 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.9 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.37 
 
 		 623 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03910  transmembrane protein, putative  25.36 
 
 		 573 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  30.41 
 
 		 728 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  27.56 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  30.83 
 
 		 149 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  31.62 
 
 		 746 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  30.97 
 
 		 198 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  25.63 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 717 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  29.73 
 
 		 735 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 		 739 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  32.48 
 
 		 739 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.61 
 
 		 214 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  30.3 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>