119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5607 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10636  transmembrane protein  77.21 
 
 
246 aa  290  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238726  normal  0.438888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  69.72 
 
 
229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  71.72 
 
 
227 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.08 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  41.34 
 
 
239 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  44.3 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.18 
 
 
623 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  34.64 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.71 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.24 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.81 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  19.74 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  19.74 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  19.74 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  28.71 
 
 
267 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  21.56 
 
 
236 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  19.3 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  19.3 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  19.3 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  26.6 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  32.21 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  28.96 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  28.96 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  28.96 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  20 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  19.3 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.55 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  31.29 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  36.43 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  31.65 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  24.38 
 
 
231 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  24.38 
 
 
231 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  28.43 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 
282 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 
282 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.11 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  25.29 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  28.04 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  28.04 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.48 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  31.07 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  21.53 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.81 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  28.11 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  27.15 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  36.75 
 
 
265 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.87 
 
 
738 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.56 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  27.15 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  21.86 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.68 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.04 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  29.14 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  23.41 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  32.76 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  30.05 
 
 
714 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  30.06 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25.22 
 
 
717 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  27.81 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  28.86 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  29.56 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  27.8 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  27.15 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  27.15 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  27.17 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  19.79 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  24.2 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  28.28 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  24.38 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  27.47 
 
 
252 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  25.17 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  26.46 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  24.58 
 
 
235 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  24.52 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 
735 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  25.81 
 
 
227 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  21.19 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  33.33 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  28.1 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  25.32 
 
 
717 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3177  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  28.95 
 
 
239 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  28.02 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  22.18 
 
 
713 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>