73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1854 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0516  SNARE associated Golgi protein  40.38 
 
 
182 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  42.95 
 
 
182 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  43.62 
 
 
182 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  41.8 
 
 
189 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2523  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.19 
 
 
185 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1816  DedA family membrane protein  43.28 
 
 
167 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.106663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4699  hypothetical protein  39.53 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000989349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  42.42 
 
 
182 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0657  hypothetical protein  42.42 
 
 
182 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85178e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  42.42 
 
 
182 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  42.42 
 
 
182 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  40.91 
 
 
182 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0512  hypothetical protein  38.76 
 
 
182 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000166734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0515  SNARE associated Golgi protein  41.41 
 
 
182 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.44 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  26.24 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  26.24 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  30.52 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.24 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  30.52 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  26.24 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  26.24 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  26.24 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  26.24 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  26.24 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.17 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  27.17 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  25.74 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  28.05 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  29.23 
 
 
239 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.34 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  25.5 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 
713 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  22.95 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  26.49 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  26.49 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.09 
 
 
705 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  29.47 
 
 
253 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  26.61 
 
 
746 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  27.87 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 
716 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  27.08 
 
 
704 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  28.74 
 
 
252 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  24.66 
 
 
732 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  24.32 
 
 
732 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  24.32 
 
 
732 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  26.35 
 
 
735 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  31.4 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  25.66 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  31.22 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  26.56 
 
 
716 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  25.52 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0956  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  28.24 
 
 
738 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.34 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  22.01 
 
 
714 aa  45.1  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  27.16 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  25.62 
 
 
722 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.88 
 
 
722 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 
717 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  26.71 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  25.95 
 
 
227 aa  41.6  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>