22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0956 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0956  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1628  hypothetical protein  54.42 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00654426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  26.44 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0963  hypothetical protein  23.72 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0982  hypothetical protein  23.72 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  25.56 
 
 		 320 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  29.59 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.61 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  27.15 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  21.61 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  23.18 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  28.4 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  27.11 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 		 209 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  25.76 
 
 		 229 aa  42  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 		 209 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.85 
 
 		 225 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  23.75 
 
 		 714 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  22.78 
 
 		 803 aa  41.6  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  26.51 
 
 		 227 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>