25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1628 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1628  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00654426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0956  SNARE associated Golgi protein  54.42 
 
 
230 aa  249  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  26.78 
 
 
215 aa  55.1  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  23.38 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.88 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  24.86 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  25.31 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  25.69 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  25.16 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.23 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  25.14 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  19.23 
 
 
197 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  20.74 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>