140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1893 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  47.73 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  41.78 
 
 		 253 aa  185  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  36.49 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  30.85 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  30.85 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  34.95 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  28.84 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 272 aa  99  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  38.04 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  33.16 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  31.52 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  29.55 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  37.32 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.49 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  26.17 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.59 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.64 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  26.38 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.33 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  28.33 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  31.33 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  26.49 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  30.72 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  27.57 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  30.92 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  29.87 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  23.78 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  27.65 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  22.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  22.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  22.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  22.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  22.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  22.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.86 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  22.02 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  22.02 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  30.36 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  29.2 
 
 		 735 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  33.14 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  32.95 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  29.77 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 325 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.66 
 
 		 701 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  32 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  23.81 
 
 		 738 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  30.14 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  28.07 
 
 		 717 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  30.09 
 
 		 746 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  27.67 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  29.82 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.97 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  26.4 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  28.33 
 
 		 714 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.01 
 
 		 713 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.46 
 
 		 717 aa  48.5  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  21.74 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  26.23 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  25.81 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.44 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  30.48 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  22.65 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  23.76 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  25.44 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  21.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  21.58 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.37 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  24.71 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.37 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2421  hypothetical protein  25.98 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.37 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 722 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.5 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>