63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1816 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1816  DedA family membrane protein  100 
 
 		 167 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.106663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  38.65 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  38.65 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  39.22 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0515  SNARE associated Golgi protein  38.56 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0516  SNARE associated Golgi protein  36.25 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2523  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.02 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  39.38 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0512  hypothetical protein  37.91 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000166734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  37.91 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4699  hypothetical protein  37.91 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000989349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0657  hypothetical protein  37.25 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85178e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  37.25 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  37.25 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  38.92 
 
 		 223 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.86 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  25.15 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.64 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  32.82 
 
 		 252 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  48.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.05 
 
 		 713 aa  48.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 		 738 aa  48.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  32.48 
 
 		 720 aa  47.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  25 
 
 		 714 aa  47.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  28.93 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.93 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  29.13 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  25.64 
 
 		 714 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.43 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1608  hypothetical protein  26.98 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.07 
 
 		 251 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.79 
 
 		 225 aa  44.7  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.27 
 
 		 623 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  29.2 
 
 		 222 aa  44.3  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  25.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  25.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  25.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  25.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  25.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  28.23 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  25.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  25.75 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  26.52 
 
 		 730 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  26.61 
 
 		 320 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 		 717 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  23.77 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  26.12 
 
 		 735 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  24.81 
 
 		 227 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.54 
 
 		 202 aa  40.4  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>