187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2268 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  62.19 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  38.22 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  34.03 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  33.7 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  40.29 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  38.35 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  37.59 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  32.89 
 
 		 272 aa  89.4  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  29.02 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  28.08 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  33.13 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  28.42 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.42 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  28.42 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  31.69 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.26 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  34.82 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  26.56 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  25.65 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  25.65 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  21.74 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  29.17 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  34.65 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  27.18 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  33.08 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.15 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  33.83 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  27.03 
 
 		 803 aa  61.6  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  36.29 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  24.05 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  25.75 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  29.88 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  29.22 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.75 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.59 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.18 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  28.76 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  20.89 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.22 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.99 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.3 
 
 		 717 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  23.59 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  20.25 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  24.24 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  24.24 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  24.24 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.24 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.52 
 
 		 722 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.48 
 
 		 722 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  24.24 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  29.81 
 
 		 717 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  24.24 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  24.24 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.09 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  29.33 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26.67 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  24.24 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.8 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.27 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.33 
 
 		 717 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  24.31 
 
 		 250 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  32.04 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  32.5 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.91 
 
 		 738 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  27.91 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.86 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  36.67 
 
 		 320 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 		 716 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.31 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.69 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  22.73 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  29.38 
 
 		 716 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  23.87 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>