97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1623 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  395  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  43.55 
 
 
201 aa  167  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  41.21 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  41.92 
 
 
227 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  39.57 
 
 
203 aa  130  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  32.32 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  34.46 
 
 
267 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  32.69 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  29.31 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  29.87 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  29.78 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  31.48 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  31.48 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  34.07 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.75 
 
 
623 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  31.58 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  27.46 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  26.24 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  29.45 
 
 
229 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  25.62 
 
 
254 aa  58.2  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  27.35 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  25.93 
 
 
252 aa  54.7  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  31.39 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.35 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  27.46 
 
 
234 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  27.54 
 
 
272 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.85 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 
272 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  51.2  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  25.76 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  22.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  22.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  22.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  22.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  22.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  22.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  26.57 
 
 
242 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  22.16 
 
 
704 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  25.28 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 
325 aa  48.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 
229 aa  48.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  27.18 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  22.07 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  25.74 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  26.72 
 
 
714 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20181  hypothetical protein  31.13 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  24.65 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  34.12 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.33 
 
 
233 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  25.56 
 
 
242 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  21.29 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  21.38 
 
 
235 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  31.13 
 
 
214 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  26.27 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  29.13 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  27.78 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  24.58 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26.51 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26.51 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  22.76 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1679  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0162437  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  28.46 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  25.23 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0449  hypothetical protein  26.61 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0743874  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  23.73 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  24.42 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  23.35 
 
 
227 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03321  hypothetical protein  27.36 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03931  hypothetical protein  29.25 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.748515  normal  0.0749833 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03331  hypothetical protein  27.36 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.83 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  24.66 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  20.14 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  26.71 
 
 
192 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  27.56 
 
 
227 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3177  SNARE associated Golgi protein  24.53 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.97 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.97 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  19.86 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  26.09 
 
 
236 aa  41.6  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0310  hypothetical protein  27.36 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.237203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  26.97 
 
 
236 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  26.97 
 
 
236 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  26.97 
 
 
236 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>