48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1878 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20181  hypothetical protein  73.68 
 
 		 214 aa  308  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0310  hypothetical protein  68.27 
 
 		 211 aa  297  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.237203  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03321  hypothetical protein  68.27 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03331  hypothetical protein  67.79 
 
 		 211 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0449  hypothetical protein  76.04 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0743874  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1679  hypothetical protein  69.81 
 
 		 219 aa  281  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0162437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03931  hypothetical protein  69.81 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.748515  normal  0.0749833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03421  hypothetical protein  77.06 
 
 		 171 aa  265  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0314258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  42.45 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  41.51 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04261  hypothetical protein  45.45 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1711  hypothetical protein  45.45 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.427303  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03691  hypothetical protein  47.55 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20551  hypothetical protein  45.77 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  42.66 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  29.44 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  29.44 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  22.03 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  30.66 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  25.81 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.98 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  27.75 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  26.2 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  27.2 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.75 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  27.75 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  26.29 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  27.75 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  27.75 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  29.72 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  27.75 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  27.75 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  30.19 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  29.38 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  27.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  27.09 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  25.79 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  27.96 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  26.56 
 
 		 225 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  29.94 
 
 		 229 aa  42  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>