75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  542  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  54.47 
 
 
254 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  52.38 
 
 
277 aa  212  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  31.3 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  30.36 
 
 
225 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  28.98 
 
 
225 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  36.6 
 
 
224 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 
267 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  29.72 
 
 
230 aa  99.4  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  27.12 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  32.16 
 
 
234 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  30.39 
 
 
211 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  33.56 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  26.74 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  25.97 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  25.56 
 
 
231 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  28.31 
 
 
201 aa  59.7  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  21.31 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  26.32 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  25.86 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  28.82 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 
325 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  27.13 
 
 
202 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  25.7 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  26.26 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  26.26 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  26.26 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  22.54 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.55 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.7 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.55 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.55 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  22.56 
 
 
226 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  22.58 
 
 
242 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  26.26 
 
 
236 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  26.67 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  26.45 
 
 
192 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  20.81 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  23.42 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  25.33 
 
 
320 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  23.03 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  21.47 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  25 
 
 
623 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  22.64 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  23.49 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  27.11 
 
 
271 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  21.39 
 
 
235 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  27.61 
 
 
239 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  23.76 
 
 
735 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
216 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  21.39 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  21.39 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  21.39 
 
 
235 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  21.39 
 
 
235 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  21.39 
 
 
235 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  22.54 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.07 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  21.39 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  22.45 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.45 
 
 
232 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  21.39 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  25.41 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  24.34 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  24.34 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  22.41 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  30.56 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  24.82 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  33.71 
 
 
217 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  24.34 
 
 
216 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1628  hypothetical protein  22.6 
 
 
231 aa  42.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00654426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>