42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0971 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  43.62 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  41.84 
 
 
203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  39.01 
 
 
197 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  38.16 
 
 
227 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  34.71 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  34.71 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  33.11 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  29.85 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 
236 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  28.31 
 
 
272 aa  60.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  34.04 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  27.73 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  24.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  27.78 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  30.36 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.83 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.25 
 
 
623 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  32.04 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  28.79 
 
 
254 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  34.67 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.44 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  28.46 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  23.97 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  36.54 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0551  hypothetical protein  23.94 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.66 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  31.82 
 
 
277 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.71 
 
 
320 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  28.66 
 
 
225 aa  41.6  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  20.81 
 
 
249 aa  41.6  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>