166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2397 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  62.19 
 
 
211 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  38.01 
 
 
267 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  36.13 
 
 
236 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  35.45 
 
 
253 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 
234 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  37.32 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  34.72 
 
 
225 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  34.72 
 
 
225 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  33.56 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  30.77 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  33.52 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  29.49 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  24.88 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  30.49 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  32.48 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 
272 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  32.89 
 
 
235 aa  62  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  28.77 
 
 
194 aa  62.4  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.56 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  33.77 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  31.29 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  31.48 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.2 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  32.85 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  27.66 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  28.18 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  28.18 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  28.18 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  27.87 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  27.87 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  31.29 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  26.14 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.14 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  26.14 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  29.8 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.4 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  26 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  32.08 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  26.21 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 
325 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  32.82 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  28.1 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  25.14 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  28.08 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 
229 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.58 
 
 
259 aa  55.1  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  32.06 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.45 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  30.91 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.56 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  28.95 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  36.45 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  31.2 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  29.05 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.23 
 
 
320 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  24.76 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  29.17 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.85 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.32 
 
 
623 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  25.89 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.67 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  30.34 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0551  hypothetical protein  24.21 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  29.63 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.44 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  30.83 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.44 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  28.97 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.97 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  29.37 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  32.31 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  26.81 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  28.92 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20551  hypothetical protein  28.28 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  23.12 
 
 
195 aa  48.5  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0963  hypothetical protein  24.18 
 
 
191 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0982  hypothetical protein  24.18 
 
 
191 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  28.08 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.33 
 
 
722 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  28.08 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  25.5 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.56 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  27.75 
 
 
202 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>