56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20551 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20551  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03691  hypothetical protein  49.77 
 
 
246 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1711  hypothetical protein  53.76 
 
 
249 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.427303  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04261  hypothetical protein  53.23 
 
 
249 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  49.74 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  49.4 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  43.88 
 
 
216 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0310  hypothetical protein  44.08 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.237203  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03321  hypothetical protein  43.42 
 
 
211 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03331  hypothetical protein  43.42 
 
 
211 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  44.22 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03931  hypothetical protein  46.26 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.748515  normal  0.0749833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03421  hypothetical protein  44.59 
 
 
171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0314258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20181  hypothetical protein  44.37 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1679  hypothetical protein  46.26 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0162437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0449  hypothetical protein  45.59 
 
 
218 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0743874  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  26.4 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  22.39 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  27.42 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  25.81 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  29.84 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  29.31 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  22.94 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.52 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  25.69 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26.32 
 
 
231 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26.32 
 
 
231 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  26.15 
 
 
236 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  23.13 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  26.14 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  25.76 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  24.44 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  25.49 
 
 
266 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  20.55 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  26.43 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.54 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.15 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  20.59 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.55 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  22.22 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  23.08 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  25.22 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.72 
 
 
200 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>