42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1711 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1711  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.427303  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04261  hypothetical protein  96.39 
 
 		 249 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03691  hypothetical protein  55.85 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20551  hypothetical protein  49.55 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  43.39 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  45.56 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  45 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0310  hypothetical protein  40.19 
 
 		 211 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.237203  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03331  hypothetical protein  40.19 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03321  hypothetical protein  39.25 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03421  hypothetical protein  45.96 
 
 		 171 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0314258  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  45.52 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03931  hypothetical protein  45.59 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.748515  normal  0.0749833 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1679  hypothetical protein  45.59 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0162437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0449  hypothetical protein  46.4 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0743874  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20181  hypothetical protein  46.32 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  22.55 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.81 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  27.88 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.4 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.88 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  24.51 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  24.87 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  24.87 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.86 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.86 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.86 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.86 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  28.45 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.63 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  22.73 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  26.4 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2421  hypothetical protein  26.88 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  24.63 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 229 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  39.44 
 
 		 217 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  28.04 
 
 		 239 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 		 226 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>