58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  50.6 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  56.63 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  33.19 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  28.64 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  34.18 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  34.18 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  31.42 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  36.84 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.09 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  29.02 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  33.77 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  23.92 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.11 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  27.72 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  27.74 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  24.3 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  21.99 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  21.38 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  23.83 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  21.88 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  21.97 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  21.97 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  21.97 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  21.97 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  21.97 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  21.97 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  21.52 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  24.59 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  27.21 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25.16 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25.16 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  25.16 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.67 
 
 		 623 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.44 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.29 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  25.16 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.16 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  25.16 
 
 		 192 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  25.16 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03691  hypothetical protein  26.19 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  26.47 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  23.9 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  22.99 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  25.2 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  23.03 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.82 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  23.97 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  22.09 
 
 		 236 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>